MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7448 chromosome

Total Repeats: 25353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007332	T	7	7	10	16	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007332	A	7	7	56	62	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007332	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007332	TAAA	2	8	106	113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007332	TGT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007332	AAACA	2	10	151	160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007332	TAC	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007332	CAAA	2	8	210	217	75 %	0 %	0 %	25 %	72080343
9	NC_007332	AAT	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
10	NC_007332	CAA	2	6	255	260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
11	NC_007332	TTA	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080343
12	NC_007332	TGT	2	6	286	291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080343
13	NC_007332	AAC	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
14	NC_007332	T	6	6	300	305	0 %	100 %	0 %	0 %	72080343
15	NC_007332	ATT	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080343
16	NC_007332	AAT	2	6	462	467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
17	NC_007332	AAAG	2	8	483	490	75 %	0 %	25 %	0 %	72080343
18	NC_007332	A	6	6	506	511	100 %	0 %	0 %	0 %	72080343
19	NC_007332	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080343
20	NC_007332	AGA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
21	NC_007332	TTC	2	6	770	775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080343
22	NC_007332	A	6	6	799	804	100 %	0 %	0 %	0 %	72080343
23	NC_007332	CTTTT	2	10	841	850	0 %	80 %	0 %	20 %	72080343
24	NC_007332	TGA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080343
25	NC_007332	AACA	2	8	873	880	75 %	0 %	0 %	25 %	72080343
26	NC_007332	TTG	2	6	892	897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080343
27	NC_007332	ATA	2	6	942	947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
28	NC_007332	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080343
29	NC_007332	TGG	2	6	974	979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080343
30	NC_007332	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
31	NC_007332	ATTAA	2	10	1023	1032	60 %	40 %	0 %	0 %	72080343
32	NC_007332	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	72080343
33	NC_007332	GAA	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
34	NC_007332	ATG	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080343
35	NC_007332	ATTCG	2	10	1150	1159	20 %	40 %	20 %	20 %	72080343
36	NC_007332	T	6	6	1189	1194	0 %	100 %	0 %	0 %	72080343
37	NC_007332	CAAA	2	8	1200	1207	75 %	0 %	0 %	25 %	72080343
38	NC_007332	AAAT	2	8	1211	1218	75 %	25 %	0 %	0 %	72080343
39	NC_007332	ATTT	2	8	1230	1237	25 %	75 %	0 %	0 %	72080343
40	NC_007332	A	7	7	1245	1251	100 %	0 %	0 %	0 %	72080343
41	NC_007332	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080343
42	NC_007332	AACA	2	8	1285	1292	75 %	0 %	0 %	25 %	72080343
43	NC_007332	A	6	6	1363	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	72080343
44	NC_007332	ATTA	2	8	1409	1416	50 %	50 %	0 %	0 %	72080343
45	NC_007332	ATA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
46	NC_007332	T	7	7	1454	1460	0 %	100 %	0 %	0 %	72080343
47	NC_007332	AAC	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
48	NC_007332	AGA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
49	NC_007332	AAT	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
50	NC_007332	A	7	7	1497	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	72080343
51	NC_007332	CAA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
52	NC_007332	AAAATA	2	12	1592	1603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080343
53	NC_007332	T	6	6	1653	1658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007332	TTA	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007332	TAT	2	6	1685	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007332	TAAA	2	8	1697	1704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007332	ATATA	2	10	1715	1724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007332	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007332	A	9	9	1759	1767	100 %	0 %	0 %	0 %	72080344
60	NC_007332	ATA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080344
61	NC_007332	T	8	8	1836	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	72080344
62	NC_007332	AAG	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080344
63	NC_007332	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080344
64	NC_007332	CAA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
65	NC_007332	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080344
66	NC_007332	A	6	6	1914	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	72080344
67	NC_007332	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080344
68	NC_007332	T	7	7	1966	1972	0 %	100 %	0 %	0 %	72080344
69	NC_007332	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080344
70	NC_007332	T	6	6	2038	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	72080344
71	NC_007332	T	6	6	2056	2061	0 %	100 %	0 %	0 %	72080344
72	NC_007332	TTC	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080344
73	NC_007332	T	7	7	2084	2090	0 %	100 %	0 %	0 %	72080344
74	NC_007332	AATTA	2	10	2117	2126	60 %	40 %	0 %	0 %	72080344
75	NC_007332	A	6	6	2159	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	72080344
76	NC_007332	CAA	3	9	2176	2184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
77	NC_007332	A	6	6	2281	2286	100 %	0 %	0 %	0 %	72080344
78	NC_007332	AATA	2	8	2309	2316	75 %	25 %	0 %	0 %	72080344
79	NC_007332	CAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
80	NC_007332	TGAT	2	8	2536	2543	25 %	50 %	25 %	0 %	72080344
81	NC_007332	ACA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
82	NC_007332	TTA	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080344
83	NC_007332	A	6	6	2597	2602	100 %	0 %	0 %	0 %	72080344
84	NC_007332	A	6	6	2657	2662	100 %	0 %	0 %	0 %	72080344
85	NC_007332	TTCGA	2	10	2704	2713	20 %	40 %	20 %	20 %	72080344
86	NC_007332	A	6	6	2803	2808	100 %	0 %	0 %	0 %	72080344
87	NC_007332	T	8	8	2902	2909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007332	A	8	8	2921	2928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007332	A	7	7	2952	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007332	A	7	7	2988	2994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007332	TTG	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080345
92	NC_007332	GGC	2	6	3037	3042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72080345
93	NC_007332	ATT	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080345
94	NC_007332	A	9	9	3075	3083	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
95	NC_007332	GTT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080345
96	NC_007332	TAA	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080345
97	NC_007332	A	6	6	3115	3120	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
98	NC_007332	TGG	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080345
99	NC_007332	GGA	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72080345
100	NC_007332	A	6	6	3334	3339	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
101	NC_007332	ATTA	2	8	3351	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	72080345
102	NC_007332	A	7	7	3389	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
103	NC_007332	A	6	6	3421	3426	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
104	NC_007332	T	7	7	3433	3439	0 %	100 %	0 %	0 %	72080345
105	NC_007332	ATT	2	6	3451	3456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080345
106	NC_007332	ACA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080345
107	NC_007332	TTC	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080345
108	NC_007332	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080345
109	NC_007332	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080345
110	NC_007332	CTT	2	6	3617	3622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080345
111	NC_007332	TATAA	2	10	3664	3673	60 %	40 %	0 %	0 %	72080345
112	NC_007332	TTTC	2	8	3677	3684	0 %	75 %	0 %	25 %	72080345
113	NC_007332	A	7	7	3702	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
114	NC_007332	ACA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080345
115	NC_007332	CCA	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72080345
116	NC_007332	A	6	6	3897	3902	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
117	NC_007332	ATG	2	6	4028	4033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
118	NC_007332	TTGAA	2	10	4046	4055	40 %	40 %	20 %	0 %	72080345
119	NC_007332	A	7	7	4054	4060	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
120	NC_007332	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
121	NC_007332	GAA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080345
122	NC_007332	A	6	6	4186	4191	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
123	NC_007332	ATG	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
124	NC_007332	TGA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
125	NC_007332	A	6	6	4372	4377	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
126	NC_007332	CAAAG	2	10	4392	4401	60 %	0 %	20 %	20 %	72080345
127	NC_007332	A	7	7	4470	4476	100 %	0 %	0 %	0 %	72080345
128	NC_007332	AATT	2	8	4508	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	72080345
129	NC_007332	GAT	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
130	NC_007332	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080345
131	NC_007332	GTG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080345
132	NC_007332	CTG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72080345
133	NC_007332	AAT	2	6	4853	4858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080346
134	NC_007332	A	6	6	4899	4904	100 %	0 %	0 %	0 %	72080346
135	NC_007332	TAA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080346
136	NC_007332	A	7	7	4986	4992	100 %	0 %	0 %	0 %	72080346
137	NC_007332	A	6	6	5017	5022	100 %	0 %	0 %	0 %	72080346
138	NC_007332	TGA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080346
139	NC_007332	AATT	2	8	5152	5159	50 %	50 %	0 %	0 %	72080346
140	NC_007332	T	6	6	5183	5188	0 %	100 %	0 %	0 %	72080346
141	NC_007332	ACC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72080346
142	NC_007332	A	7	7	5299	5305	100 %	0 %	0 %	0 %	72080346
143	NC_007332	GAAAA	2	10	5316	5325	80 %	0 %	20 %	0 %	72080347
144	NC_007332	A	6	6	5322	5327	100 %	0 %	0 %	0 %	72080347
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402	NC_007332	T	7	7	14718	14724	0 %	100 %	0 %	0 %	72080355
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413	NC_007332	AT	3	6	15129	15134	50 %	50 %	0 %	0 %	72080356
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418	NC_007332	A	7	7	15441	15447	100 %	0 %	0 %	0 %	72080356
419	NC_007332	A	6	6	15545	15550	100 %	0 %	0 %	0 %	72080356
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